El género Mycobacterium provoca infecciones tanto pulmonares como extrapulmonares, dentro de estas últimas las localizaciones más frecuentes son; tejido procedente de ganglios linfáticos,  y fluidos corporales, las menos frecuentes; infecciones en piel, médula ósea, hígado, riñón, meninges, pericardio tracto gastrointestinal, otros. El objetivo de nuestro estudio fue realizar la  ¨caracterización microbiológica¨  de las  infecciones extrapulmonares producidas por Mycobacterium, destacando la  importancia de este tipo de infecciones,  tanto en pacientes sintomáticos, y especialmente en  los pacientes VIH/sida. Nuestro  estudio se realizó de  junio 2012 – marzo 2014, en este período nuestro laboratorio recibió un total de 3356 muestras, de estas  823 fueron muestras  extrapulmonares;  593 (pacientes VIH/sida), y  232 (pacientes inmunocompetentes). Las muestras extrapulmonares que requerían de descontaminación previa al cultivo, se les aplicó el método de ácido sulfúrico al 4%, para el cultivo se utilizó el medio  de Löwenstein-Jensen, a los cultivos positivos se le realizó examen directo para confirmar la presencia de bacilos ácido-alcohol resistentes. Para la clasificación e identificación de los cultivos se  realizaron las técnicas fenotípicas – bioquímicas recomendadas. De las 825 muestras extrapulmonares se obtuvo cultivos positivos en 29 (3.5%) , 15 (51,7%) casos de Micobacteriosis (12 VIH+ y 4 VIH-), y 14 (48.3%) de Tuberculosis (11 VIH+ y 3 VIH-). Las especies micobacterianas más aisladas fueron: Mycobacterium tuberculosis,  Mycobacterium avium-intracellulare, y Mycobacterium malmoense. Por todo lo anteriormente expuesto se recomienda  mantener la vigilancia de estas importantes infecciones,  principalmente en pacientes  VIH+ pues en muchos casos  pueden tener  fatales consecuencias.